Dès que la date de redémarrage du réacteur fut planifiée, commença en septembre 1993 le travail de nettoyage des halls expérimentaux ILL7 et ILL22, et le travail permettant de rendre à nouveau opérationnels les instruments scientifiques.
Durant la phase de réinstallation, une équipe externe de nettoyeurs acrobatiques effectua un nettoyage approfondi des halls expérimentaux, du sol au plafond, pour la 1ère fois en 20 ans.

Dès la mise en place du 1er doigt de gant (H11), le 28 mars 1994, la réinstallation des instruments du niveau C a pu démarrer, avec la contrainte du partage de la grue avec l’équipe du réacteur. Cette dernière a réinstallé les doigts de gants jusqu’au 1er juin, et l’équipe d’EDEX réinstallait les protections.
Le réacteur devait être techniquement prêt à produire des neutrons à la mi-juillet 1994, il ne restait donc que 3 mois et demi pour effectuer la ré-installation complète des instruments, de leurs protections, de tous les circuits débranchés lors du démontage et le ré-alignement.
Ceci fut rendu possible par le travail volontaire de deux équipes de techniciens et ingénieurs d’EDEX et de DIM, travaillant entre 6h et 22h.

Au fur et à mesure de la ré-installation, les responsables d’instruments ont pu, rebrancher, redémarrer et tester les matériels électroniques et informatiques. Grâce aux efforts du personnel technique et scientifique, tous les instruments qui avaient été démontés, sont redevenus opérationnels et prêts pour les tests aux neutrons avant la fin d’octobre 1994.
Durant cette période d’activité intense, après l’installation du nouveau système en pile des guides H1/H2, le DIM a également réinstallé et réaligné tous les guides de neutrons pour les instruments d’ILL7, ainsi que les nouveaux guides pour ILL22, de telle sorte que l’ensemble des instruments a pu fonctionner de nouveau dès le redémarrage du réacteur.